Kryptosporidiose wurde bei einer Vielzahl verschiedener Reptilienarten berichtet. Diese Krankheit scheint sowohl in wilden als auch in Gefangenschaft gehaltenen Reptilienpopulationen verbreitet zu sein, und die Übertragung erfolgt über den fäkal-oralen Weg. Infizierte Reptilien zeigen möglicherweise keine Symptome, scheiden jedoch sporadisch Oozysten (Eier) aus. Zu den klinischen Anzeichen einer Crypto-Infektion gehören Aufstoßen und Gewichtsverlust, begleitet von einer abnormalen Zunahme der Schleimhautschicht des Magens.
Die Diagnose von Kryptosporidiose kann schwierig sein. Eine diagnostische Methode ist die Identifizierung von Oozysten in einer Stuhlprobe mittels säurefester Färbung. Ein negativer säurefester Fleck zeigt nur an, dass das Reptil zum Zeitpunkt der Probenahme nicht vergossen hat, und bedeutet nicht, dass das Tier kryptofrei ist. Die Standardpraxis besteht darin, dreimal zu testen, bevor davon ausgegangen wird, dass das Tier frei von Krankheiten ist. Endoskopie, einschließlich Magenspülung und Biopsie, kann auch verwendet werden, um diese Krankheit zu identifizieren.
Die bei Reptilien am häufigsten vorkommenden Arten von Kryptosporidiose sind C. serpentis, C. muris und C. parvum. Es wurde vermutet, dass die gefundenen C. parvum-Ozysten (basierend auf Mäusen) wahrscheinlich von Nagetieren stammten, die von den Reptilien aufgenommen wurden, und nicht von einer tatsächlichen Crypto-Infektion. Diese Möglichkeit, Reptilien mit C. parvum zu infizieren, kann nur durch weitere sorgfältige biologische und genetische Untersuchungen vollständig ausgeschlossen werden.
Im März 1999 startete der Saint Louis Zoo ein Diagnose- und Euthanasieprogramm, nachdem auf seinem Gelände chronische Cryptosporidien bei Schlangen identifiziert worden waren. Um die Wirksamkeit der Kontrollmaßnahmen zu überwachen, wurden über einen Zeitraum von einem Jahr regelmäßig Schlangenproben gesammelt. Kurz nach Beginn der Kontrollmaßnahme waren im Mai bzw. Juni 1999 5 von 10 bzw. 8 von 17 Schlangenproben positiv für Crypto. Anschließend war nur eine von 45 Schlangenproben, die über fünf verschiedene Zeiträume gesammelt wurden, positiv für Kryptosporidiose.
Derzeit gibt es keine wirksamen Bekämpfungsstrategien gegen Cryptosporidium bei Reptilien. In einer kleinen Studie wurde gezeigt, dass Schlangen mit klinischem und subklinischem Cryptosporidium mit hyperimmunem Rinderkolostrum, das gegen C. parvum gezüchtet wurde, wirksam behandelt (nicht geheilt) werden können. Strenge Hygiene und Quarantäne infizierter und exponierter Tiere sind für die Kontrolle der Kryptosporidiose obligatorisch, aber die meisten entscheiden sich für die Euthanasie infizierter Tiere. Die beste Methode, um die Ausbreitung von Crypto zu verhindern, besteht darin, infizierte Reptilien einzuschläfern.
Kryptozysten werden nur neutralisiert, indem sie 5 bis 9 Minuten lang feuchter Hitze zwischen 113 ° und 140 ° F ausgesetzt werden und 18 Stunden lang mit Ammoniak (5 %) oder Kochsalzlösung (10 %) desinfiziert werden. Zu den unwirksamen Desinfektionsmitteln gehörten Idophore (1–4 %), Cresylsäure (2,5 % und 5 %), Natriumhypochlorit (3 %), Benzalkoniumchlorid (5 % und 10 %) und Natriumhydroxid (0,02 m). Alles, was mit einem infizierten Reptil in Kontakt gekommen sein könnte, sollte gründlich mit einer Ammoniaklösung gereinigt und mindestens 3 Tage lang trocknen gelassen werden.